Traitement des données biologiques

Présentation

Outre la compréhension de l’approche et des méthodes biostatistiques, un effort particulier sera porté sur la pratique de l'analyse des données avec un logiciel dédié : c'est pour atteindre cet objectif que les enseignements pratiques seront tous dispensés sous la forme de TP en salle informatique et à l’aide du langage R.

Pré-requis nécessaires

Connaissances de base sur l'échantillonnage et sur les biostatistiques

Licence de Biologie, VAE ou équivalent

Descriptif

  • Plans d’échantillonnage
  • Présentation des données
  • Probabilités et lois
  • Paramètres des distributions, Intervalles de confiance
  • Inférence statistique
  • Méthodes de randomization : Bootstrap, jackknife, tests par permutations
  • Tests paramétriques et non paramétriques usuels
    • Tests de conformité
    • Tests de comparaison de position pour 2 échantillons indépendants et appariés
    • Tests de comparaison de variance pour 2 échantillons indépendants
    • Tests de corrélations linéaires et monotones
  • Modèles linéaires
    • Analyse de variance
    • Régression linéaire simple
    • Régression linéaire multiple
    • Analyse de covariance
  • Initiation à l’analyse multidimensionnelle

Travaux pratiques en langage R

Modalités de contrôle des connaissances

Session 1 ou session unique - Contrôle de connaissances

Nature de l'enseignementModalitéNatureDurée (min.)NombreCoefficientRemarques
CC3/7
CTEcrit - devoir surveillé18014/7

Session 2 : Contrôle de connaissances

Nature de l'enseignementModalitéNatureDurée (min.)NombreCoefficientRemarques
CTEcrit - devoir surveillé1801100%