Traitement des données biologiques
Présentation
Outre la compréhension de l’approche et des méthodes biostatistiques, un effort particulier sera porté sur la pratique de l'analyse des données avec un logiciel dédié : c'est pour atteindre cet objectif que les enseignements pratiques seront tous dispensés sous la forme de TP en salle informatique et à l’aide du langage R.
Pré-requis nécessaires
Connaissances de base sur l'échantillonnage et sur les biostatistiques
Licence de Biologie, VAE ou équivalent
Descriptif
- Plans d’échantillonnage
- Présentation des données
- Probabilités et lois
- Paramètres des distributions, Intervalles de confiance
- Inférence statistique
- Méthodes de randomization : Bootstrap, jackknife, tests par permutations
- Tests paramétriques et non paramétriques usuels
- Tests de conformité
- Tests de comparaison de position pour 2 échantillons indépendants et appariés
- Tests de comparaison de variance pour 2 échantillons indépendants
- Tests de corrélations linéaires et monotones
- Modèles linéaires
- Analyse de variance
- Régression linéaire simple
- Régression linéaire multiple
- Analyse de covariance
- Initiation à l’analyse multidimensionnelle
Travaux pratiques en langage R