Adaptation à l'environnement

Présentation

Il s'agit d'une UE mutualisée entre l'UBO et l'UR1:

Module

Nom

Horaires

Format

enseignement

Langue

Mutualisation

Equipe pédagogique

Responsable

CM

TD

TP

Terrain

1

AEN-1

12

0

0

 

Présentiel visio UR1 - UBO

Fr

Non

Microbiologie UR1

Gwennola Ermel

2

AEN -2

12

0

0

 

Présentiel visio UR1 - UBO

Fr

Non

Microbiologie UBO

Mohamed Jebbar

3

AEN -3

0

6

0

 

Présentiel UR1

Fr

Non

Microbiologie UR1

Gwennola Ermel

4

AEN -4

0

6

0

 

Présentiel UBO

Fr

Non

Microbiologie UBO

Mohamed Jebbar

·         Cours

AEN-1 :

-            Compréhension des différentes réponses adaptatives des bactéries à différents environnements stressants : variations osmotiques, température, carence, présence d’oxydants…

-            Rôle de ces différentes réponses adaptatives des bactéries dans les relations avec l'hôte : pathogénie et symbiose

AEN -2 :

Cycles biogéochimiques majeurs (Rôles des micro-organismes et interaction avec l’environnement)

         Cycle du carbone

                     Syntrophie et méthanogenèse

                     Méthanisation

         Cycle de l’azote

         Cycle du soufre

         Cycle du fer

Bioremédiation et biolixiviation microbienne à à mettre dans l'UE TBD ?

Rôles fonctionnels des virus dans les cycles biogéochimiques (boucle microbienne, flux de carbone)

Rôles des éléments génétiques mobiles dans l’adaptation de leurs hôtes microbiens

Etude de communautés microbiennes de niches écologiques particulières

         Exemple de milieu aquatique: l’océan profond ?

Sporulation ? Autres différenciations cellulaires (ex. Caulobacter, Myxococcus xanthus, cyanobactéries…) ??

Interaction minéraux et micro-organismes ?

(Symbioses, biofilms et QS seront donnés dans une autre UE) cela est fait dans une autre UE (IBA : Christine et Mohamed)

·         Travaux dirigés

AEN -3 :

Les TD  seront consacrés à l’analyse de démarches expérimentales et de données de la littérature en rapport avec le programme du cours.

AEN -4 :

Les TD  seront consacrés à l’analyse de démarches expérimentales et de données de la littérature en rapport avec le programme du cours.

·         Travaux pratiques : pas de travaux pratiques

Pré-requis nécessaires

Notions de bactériologie générale et de physiologie bactérienne

Compétences visées

Savoir utiliser les méthodes de caractérisation des changements tant en terme d'expression de gènes que physiologiques.

Bibliographie

Publications scientifiques illustrant les cours magistraux