Diversité du métabolisme

Présentation

·         Cours magistraux

Introduction et rappels, métabolismes énergétiques et cycles géochimiques terrestres                                                                                                        

Oxydo-réduction, transport d'électrons et force proton-motrice              

Les chimiotrophes (respirations aérobies et anaérobies, CO2 comme accepteur d'électrons, les fermentations lactiques, acétiques, butyrique etc..)

Les phototrophes (photosynthèses oxygénique et anoxygénique)                                  

Les autotrophes (cycle de Calvin, cycle inverse de l'acide citrique, hydroxypropionate, voies de l'acétyl-CoA etc.)

Les hétérotrophes (hétérotrophies complexes) et syntrophies, oxydation des hydrocarbures, dégradation des polymères, des lipides

 

·         Travaux dirigés

 

 

Les travaux dirigés seront réalisés pour préparer les expérimentations qui seront réalisées en TP PMP (lecture et compréhension des différents  protocoles qui seront réalisés en TP, organisation des séances selon les expériences à effectuer,  répartitions des tâches au sein des groupes de travail), ainsi que pour présenter les résultats obtenus, les commenter et les remettre en contexte d’après les données de la littérature.

Pré-requis nécessaires

Notions de bactériologie générale

Compétences visées

Etre capable de choisir les conditions de croissance favorables aux procaryotes selon leurs caractéristiques physiologiques et leurs types métaboliques. Comprendre les processus métaboliques impliqués dans les grands cycles géochimiques, mais également en biotechnologie (fermentations d’intérêt industriel) ou lors de l’altération des aliments.

Bibliographie

Brock, Biologie des micro-organismes Broché – 17 septembre 2007 de Michael Madigan (Auteur), John Martinko (Auteur), Daniel Prieur (Traduction)

  Mini manuel de microbiologie : cours et QCM-QROC, Daniel Prieur (Auteur) Claire Geslin (Auteur) Paru en juin 2015 Scolaire / Universitaire (broché)

Modalités de contrôle des connaissances

Session 1 ou session unique - Contrôle de connaissances

Nature de l'enseignementModalitéNatureDurée (min.)NombreCoefficientRemarques
CMCCEcrit - devoir surveillé

Session 2 : Contrôle de connaissances

Nature de l'enseignementModalitéNatureDurée (min.)NombreCoefficientRemarques