Acquisition et analyse d'images en microscopie optique

Objectifs

Cette UE est ouverte à 10 étudiant.e.s sélectionné.e.s en amont par les responsables d’UE. Les critères de sélection seront exposés lors de la présentation de l’UE à la rentrée universitaire.

Cette option porte sur l’acquisition de données biologiques en microscopie jusqu’au traitement et l’analyse informatique de ces données.

Deux groupes de 5 étudiant.e.s devront être en capacité d’employer des outils de microscopie et de traitement d’images pour proposer une étude approfondie, sous format projet, des données biologiques issues de cellules ou de tissus qu’ielles auront préparé.

Compétences visées

Identifier, sélectionner et analyser avec esprit critique diverses ressources dans son domaine de spécialité pour documenter un sujet et synthétiser ces données en vue de leur exploitation.

Analyser et synthétiser des données en vue de leur exploitation.

Développer une argumentation avec esprit critique.

Se servir aisément des différentes modalités d’expression scientifique (écrite et orale) et identifier le processus de production, de diffusion et de valorisation des savoirs.

Communiquer par oral et par écrit, de façon claire et non-ambiguë, dans au moins une langue étrangère.

Situer son rôle et sa mission au sein d'une organisation pour s’adapter et prendre des initiatives.

Respecter les principes d’éthique, de déontologie et de responsabilité dans les domaines scientifique, sociétal et environnemental.

Travailler en équipe et en réseau ainsi qu’en autonomie et en responsabilité au service d’un projet.

Utiliser les outils numériques de référence et les règles de sécurité informatique pour acquérir, traiter, produire et diffuser de l’information ainsi que pour collaborer en interne et en externe.

Mobiliser, pour traiter une problématique du domaine ou analyser un document de recherche ou de présentation, les concepts fondamentaux et les technologies de : 

biologie cellulaire

physiologie

immunologie

physique

Mobiliser les concepts et les outils des mathématiques, de la physique, de la chimie et de l’informatique dans le cadre des problématiques des sciences du vivant.

Mobiliser les concepts fondamentaux des échelles microscopiques aux échelles macroscopiques pour situer des problématiques en biologie.

Identifier, choisir et appliquer une combinaison d’outils analytiques (techniques courantes, instrumentation) adaptés pour caractériser les organismes (de la biomolécule à l’individu dans sa complexité) et leur fonctionnement aux différents niveaux d’analyse (métabolisme intracellulaire, biologie et physiologie des organismes complexes, interactions entre individus et groupes, interactions avec le milieu).

Identifier les réglementations spécifiques et mettre en œuvre les principales mesures de prévention en matière d'hygiène et de sécurité.

Identifier et mener en autonomie les différentes étapes d’une démarche expérimentale.

Interpréter des données expérimentales pour envisager leur modélisation.

Valider un modèle par comparaison de ses prévisions aux résultats expérimentaux et apprécier ses limites de validité.

Identifier les sources d’erreur pour calculer l’incertitude sur un résultat expérimental.

Exploiter des logiciels d’acquisition et d’analyse de données avec un esprit critique.