Outils Mathématiques pour les Biologistes

Pré-requis nécessaires

• Connaissances de base en biologie en particulier dans le domaine de la biologie cellulaire, de la biochimie, de l’écologie, et des statistiques
• Pas de prérequis concernant les mathématiques

Objectifs

• Découvrir la modélisation mécaniste et ses applications en biologie et en écologie
• Prendre en main les outils de mise en œuvre (programmation)

Compétences visées

• Réaliser des modèles mécanistes (individus, écosystèmes) simples
• Se familiariser avec les notions de dimensions physiques et d’ordres de grandeurs
• Intégrer dans le temps une équation différentielle
• Concevoir et écrire des programmes informatiques

Descriptif

Connaissant les difficultés que peuvent avoir les étudiants de biologie concernant les approches mathématique et informatique, cette UE se veut une introduction abordable. Elle fait intervenir des enseignants écologues, mathématiciens et physiciens, et s’organise en deux parties.
Une première partie au cours de laquelle sont abordées les notions et outils de base en modélisation mécaniste, incluant les bilans de matière/d’énergie, l’intégration numérique, les bases de la programmation. Cette partie est entièrement basée sur la pratique, les enseignements se faisant en salle informatique.
La seconde partie se base sur du travail sur projet : les étudiants se voient confier la réalisation d’un modèle qui subira une perturbation d’origine anthropique. Par la modélisation, les étudiants devront évaluer quel est l’impact de celle-ci sur le fonctionnement du système. L’évaluation portera sur la réalisation de ces projets.