Présentation

Il s'agit d'une UE mutualisée entre l'UBO et l'UR1:

·         Cours

AEN-1 :

-            Compréhension des différentes réponses adaptatives des bactéries à différents environnements stressants : variations osmotiques, température, carence, présence d’oxydants…

-            Rôle de ces différentes réponses adaptatives des bactéries dans les relations avec l'hôte : pathogénie et symbiose

AEN -2 :

Cycles biogéochimiques majeurs (Rôles des micro-organismes et interaction avec l’environnement)

         Cycle du carbone

                     Syntrophie et méthanogenèse

                     Méthanisation

         Cycle de l’azote

         Cycle du soufre

         Cycle du fer

Bioremédiation et biolixiviation microbienne à à mettre dans l'UE TBD ?

Rôles fonctionnels des virus dans les cycles biogéochimiques (boucle microbienne, flux de carbone)

Rôles des éléments génétiques mobiles dans l’adaptation de leurs hôtes microbiens

Etude de communautés microbiennes de niches écologiques particulières

         Exemple de milieu aquatique: l’océan profond ?

Sporulation ? Autres différenciations cellulaires (ex. Caulobacter, Myxococcus xanthus, cyanobactéries…) ??

Interaction minéraux et micro-organismes ?

(Symbioses, biofilms et QS seront donnés dans une autre UE) cela est fait dans une autre UE (IBA : Christine et Mohamed)

·         Travaux dirigés

AEN -3 :

Les TD  seront consacrés à l’analyse de démarches expérimentales et de données de la littérature en rapport avec le programme du cours.

AEN -4 :

Les TD  seront consacrés à l’analyse de démarches expérimentales et de données de la littérature en rapport avec le programme du cours.

·         Travaux pratiques : pas de travaux pratiques